Основные задачи ИМА: проведение политики ФГБОУ ВО СибАДИ в области подготовки магистров и аспирантов; планирование, организация, контроль, регулирование и координация процесса реализации образовательных программ подготовки магистров, аспирантов; содействие развитию перспективных научных исследований и их реализации при подготовке магистерских диссертаций, диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук и пр.